Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC90BQ9GZT6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms