Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms