Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms