Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAPERQ9BY12 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms