Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2AFJQ9BTM1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms