Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCGF1Q9BSM1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms