Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CITED1Q99966 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CITED1Q99966 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED1Q99966 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CITED1Q99966 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED1Q99966 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED1Q99966 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED1Q99966 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED1Q99966 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED1Q99966 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED1Q99966 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms