Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP2Q96SN8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP2Q96SN8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms