Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKK2Q96RR4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKK2Q96RR4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms