Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2Q96Q42 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms