Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SORCS2Q96PQ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SORCS2Q96PQ0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms