Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE2Q96MF7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms