Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPNS2Q96L46 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms