Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms