Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC136Q96JN2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms