Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM17Q96I25 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM17Q96I25 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms