Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCANQ96GW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms