Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIRT1Q96EB6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms