Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms