Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG2BQ96BY7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG2BQ96BY7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms