Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms