Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF34Q969K3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms