Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms