Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCC1Q92922 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms