Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATAD2BQ8WXI9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATAD2BQ8WXI9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATAD2BQ8WXI9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATAD2BQ8WXI9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms