Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms