Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00116Q8NCU8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00116Q8NCU8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms