Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPC24Q8NBT2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms