Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms