Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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RNF148Q8N7C7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF148Q8N7C7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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