Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms