Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U2

TMEM61, Transmembrane protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM61Q8N0U2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMEM61Q8N0U2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms