Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP1Q86WV1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms