Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC84Q86UT8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms