Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms