Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST3Q7LGC8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms