Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM5Q71RC9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms