Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXIP1Q6ZW49 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms