Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms