Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC62Q6P9F0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC62Q6P9F0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms