Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms