Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCTP1Q6DN14 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms