Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX8Q68G74 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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