Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms