Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms