Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms