Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms