Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms