Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZC2HC1CQ53FD0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms