Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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